台商在祖国大陆应是以外商投资企业的组织形态从事经贸活动，除非以当地人名义成立内资企业（东莞过去工商局也曾让台湾人成立内资企业，但已被中央予以纠正），对于此二种税法（前者于91年7月开始执行，后者于94年1月开始执行）的差异有所了解。比较祖国大陆内外资企业所得税有关的规定，两套税制在应纳税所得额计算、在所得的纯收益原则、权责发生制、收入与费用的配比原则、历史成本原则、独立企业原则和固定资产折旧、无形资产摊销、坏帐损失的处理、纳税年度的确定、亏损结转等方面基本上已趋一致。
　　
　　但两套税制在确定税基方面，仍存在以下两方面的差异： 一是税前扣除规定不同，主要是坏帐处理、业务招待费、企业职工工资支出，以及损赠支出等的规定不同； 二是资产的税务处理规定不同，主要是固定资产的折旧年限、固定资产净残值率规定不同。从以上两方面的差异可以看出，在税基